NGS EN EL DIAGNÓSTICO DEL CÁNCER DE PULMÓN
El diagnóstico del cáncer de pulmón implica la realización de varias pruebas. Desde pruebas de imagen como radiografías o Tomografía Axial Computarizada (TAC) para evaluar sospechas, hasta análisis de biopsias para confirmar o descartar la presencia de un tumor.
Esas biopsias de tejido tumoral , se pueden analizar genéticamente y esto permite conocer mejor la biología de ese tumor, buscar alteraciones genéticas potencialmente tratables y, por tanto, ofrecer tratamientos más útiles para cada paciente, teniendo en cuenta además el momento en el que se encuentra la enfermedad.
Para realizar este análisis genético de forma más completa, y normalmente previo al inicio del tratamiento, una de las pruebas diagnósticas más importantes es la secuenciación genética masiva (también llamada de nueva generación o Next-Generation Sequencing, con las siglas del inglés NGS).
¿Qué implican determinadas alteraciones genéticas en el cáncer de pulmón?
¿Cómo se usa la NGS en el diagnóstico del cáncer de pulmón?
¿Qué implican determinadas alteraciones genéticas en el cáncer de pulmón?
El cáncer de pulmón es una enfermedad que suele requerir de varias pruebas para confirmar su diagnóstico y para saber en qué estadio se encuentra el cáncer en el momento de su descubrimiento.
Normalmente, ante una sospecha, es habitual (aunque no el único procedimiento) hacer pruebas de imagen para observar los pulmones y, en caso de detectar algo sospechoso, es necesario un diagnóstico confirmatorio a través de un análisis de una muestra tomada del tejido.1
Además de confirmar en qué fase se encuentra el cáncer en el momento del diagnóstico, se debe estudiar si el tumor posee alguna alteración genética. Estas posibles alteraciones, que suelen darse en un porcentaje elevado en casos de cáncer de pulmón no microcítico (CPNM), pueden provocar que el tumor produzca proteínas alteradas, las cuales alteran el funcionamiento normal de estas células y las convierte en células tumorales al favorecer su crecimiento y supervivencia.2
Para algunas de estas alteraciones genéticas presentes en el CPNM, como en los genes EGFR (entre 10-20%), ALK (5%), ROS1 (1-2%), RET, BRAF etc., existen además terapias dirigidas que reconocen específicamente las proteínas alteradas que producen y son capaces de contrarrestarlas, anulando estos mecanismos de supervivencia y crecimiento descontrolado.
La técnica de NGS para el diagnóstico del cáncer de pulmón
Tras descubrir la presencia de un cáncer, y especialmente en casos de CPNM, es recomendable realizar una prueba para comprobar los niveles de PD-L1, un biomarcador predictivo de respuesta a inmunoterapia junto con junto con otras alteraciones moleculares presentes como las que afectan a los genes EGFR (entre 10-20%), ALK (5%), ROS1 (1-2%), RET o BRAF; y relacionados con tratamientos dirigidos en CPNM. 3
Las técnicas normalmente utilizadas para evaluar estas alteraciones moleculares son: a) la inmunohistoquímica, b) la hibridación in situ (también llamada FISH por sus siglas en inglés) y c) la secuenciación masiva o NGS. La NGS tiene ciertas ventajas como evaluar múltiples alteraciones genéticas en una sola prueba diagnóstica o reducir los tiempos de obtención de resultados. 1,4
Como se ha comentado previamente, las alteraciones se detectan a través de una biopsia del tejido afectado o, en ocasiones, a través de una biopsia líquida (o muestra de sangre).1,4
Actualmente, una de las técnicas más utilizadas para detectar estas alteraciones genéticas es la secuenciación genética de nueva generación o NGS, por sus siglas en inglés (next-generation sequencing).1,4
Es una técnica de secuenciación genética de alto rendimiento que permite secuenciar rápidamente los pares de bases de las muestras de ADN o ARN con alta especificidad y sensibilidad. Además, es una técnica de secuenciación muy recomendada por la gran cantidad de alteraciones que analiza y actualmente se dispone de una amplia variedad de plataformas y kits comercializados.4,5
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